국토해양부는 2009년에 고질적인 항만민원 개선과 항만운영 효율성 제고를 위해 전국 11개 지방해양항만청과 3개 항만공사에서 발굴, 시행한 총78개 개선과제들을 평가한 결과, 여수지방해양항만청의 ‘광양항 접안여건 개선을 통한 야간도선 제한 완화’를 최우수 사업으로, 포항지방해양항만청의 ‘체선율 저감을 위한 항만시설 확보’를 우수사업으로, 마산지방해양항만청의 ‘마산항 중량화물처리 중심항만 육성’을 장려사업으로, 종합적으로 우수한 성적을 거둔 여수지방해양항만청을 우수기관으로 선정하여 2010년 1월 18일 사업담당자에게 장관표창과 포상금을 수여하였다.

    * 포상금 내역 : (최우수) 200, (우수) 150, (장려) 100, (우수기관) 100만원

 최우수 사업으로 선정된 ‘광양항 접안여건 개선을 통한 야간도선 제한 완화’사업은 여수지방해양항만청이 도선사와 항만이용자들간의 이견을 적극적으로 조정하고 이해관계자 참여 하에 안전점검을 실시하면서 관련 시설투자를 지원함으로써 1~3만톤급 위험물 선박에 대한 야간 입출항 제한을 금년 1월부터 해제하는 데 기여한 점을 높게 평가받았다.  

우수사업으로 선정된 포항지방해양항만청의 ‘체선율 저감을 위한 항만시설 확보’사업은 해군을 지속적으로 설득하여 기존 해군 부두시설을 일반 선박 부두시설로 사용할 수 있게 하였고 포항신항 파제재를 개량하여 소형선 선석으로 활용하여 부두개발 예산 절약과 체선율 저감에 크게 기여한 점을 인정받았다.

장려사업으로 선정된 마산지방해양항만청의 ‘마산항 중량화물처리 중심항만 육성’ 사업은 민원 때문에 10여년 동안 방치된 제5부두 배후부지에 대해 행정대집행을 과단성 있게 추진하고 포장을 완료하여 제5부두 재개발 추진 토대를 마련한 점이 인정되었다.

 한편, 항만운영개선사업 평가제도는 2004년부터 시행하고 있는 제도로 항만이용자들 중심으로 평가단을 구성하고 서류심사, 현장실사, 최종평가 등 3단계로 항만운영개선과제들을 평가, 우수과제를 시상하여 현장 항만기관들의 동기를 부여하는 제도이다.